Javascript è attualmente disabilitato nel tuo browser.Diverse funzionalità di questo sito non funzioneranno mentre javascript è disabilitato.accesso aperto alla ricerca scientifica e medicaDalla presentazione alla prima decisione editoriale.Dall'accettazione editoriale alla pubblicazione.La suddetta percentuale di manoscritti è stata respinta negli ultimi 12 mesi.Riviste scientifiche e mediche peer-reviewed ad accesso libero.Dove Medical Press è membro dell'OAI.Ristampe in blocco per l'industria farmaceutica.Offriamo vantaggi reali ai nostri autori, inclusa l'elaborazione accelerata degli articoli.Registra i tuoi dettagli specifici e farmaci specifici di interesse e abbineremo le informazioni fornite agli articoli dal nostro ampio database e ti invieremo prontamente copie PDF via e-mail.Torna a Diari » Journal of Inflammation Research » Volume 15Autori Sun M, Yang Q, Hu C, Zhang H, Xing LPubblicato il 5 aprile 2022 Volume 2022:15 Pagine 2199—2212DOI https://doi.org/10.2147/JIR.S355225Revisione tramite revisione tra pari anonima singolaEditore che ha approvato la pubblicazione: Dott.ssa Monika SharmaMengfei Sun,1,* Qianqian Yang,2,* Chunling Hu,1 Hengchao Zhang,2 Lihua Xing1 1Dipartimento di Medicina Respiratoria e Critica, Primo Ospedale Affiliato dell'Università di Zhengzhou, Zhengzhou, 450052, Repubblica Popolare Cinese;2Department of Erythrocyte Biology Laboratory, School of Life Sciences, Zhengzhou University, Zhengzhou, 450052, People's Republic of China *Questi autori hanno contribuito in egual modo a questo lavoro Corrispondenza: Lihua Xing, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, No. 1 Jianshedong Road, Zhengzhou , Henan, 450052, Repubblica popolare cinese, Tel/Fax +8613838095088, Email [email protected] Scopo: i geni correlati all'autofagia (ARG) svolgono un ruolo importante nei processi fisiopatologici della sindrome da distress respiratorio acuto indotta da sepsi (ARDS).Tuttavia, i profili di espressione degli ARG sono stati usati raramente per esplorare la relazione tra autofagia e ARDS indotta da sepsi.Pertanto, miriamo a identificare e convalidare i potenziali ARG dell'ARDS indotto dalla sepsi attraverso l'analisi bioinformatica e la convalida dell'esperimento.Metodi: abbiamo scaricato i dati GSE32707 dal database Gene Expression Omnibus (GEO).I potenziali geni differenzialmente espressi (DEG) e gli ARG differenzialmente espressi (DEARG) dell'ARDS indotto dalla sepsi sono stati proiettati dal software R.Quindi, abbiamo eseguito analisi di arricchimento funzionale per esplorare le potenziali funzioni biologiche dei DEARG e le reti di interazione proteina-proteina (PPI) costruite.Successivamente, per i DEARG sono state utilizzate l'analisi di correlazione e la curva caratteristica operativa del ricevitore (ROC).Inoltre, abbiamo stimato le proporzioni di 22 sottoinsiemi di cellule immunitarie utilizzando l'algoritmo CIBERSORT.Infine, l'espressione di RNA di sette DEARG è stata convalidata mediante qRT-PCR in campioni di sangue da ARDS indotta da sepsi e controlli sani.RISULTATI: Abbiamo identificato 28 DEARG, inclusi 11 geni sovraregolati e 17 geni sottoregolati, che erano principalmente coinvolti nell'autofagia e nell'apoptosi.Sette geni (BAG3, CTSD, ERBB2, MYC, PEA15, RAB24 e SIRT1) con AUC > 0,70 sono stati considerati possibili geni hub ARDS indotti da sepsi per l'analisi della curva ROC.I risultati di CIBERSORT hanno mostrato che l'ARDS indotto dalla sepsi conteneva una percentuale maggiore di cellule T CD4+ naive, cellule T gamma delta, monociti e neutrofili e livelli inferiori di cellule T CD8+, cellule T CD4+ a riposo in memoria, cellule T helper follicolari erano relativamente inferiori.I risultati di qRT-PCR hanno anche dimostrato che i livelli di espressione di BAG3, CTSD, ERBB2, MYC e SIRT1 nei pazienti con ARDS indotta da sepsi e nei controlli sani presentavano differenze.Conclusione: Abbiamo identificato un'associazione tra DEG e infiltrazione immunitaria nell'ARDS indotta da sepsi e convalidato BAG3, CTSD, ERBB2, MYC e SIRT1 che potrebbero avere eccellenti prestazioni diagnostiche.Parole chiave: autofagia, ARDS indotta da sepsi, infiltrazione immunitaria, analisi bioinformatica, set di dati Gene Expression OmnibusLa sindrome da distress respiratorio acuto (ARDS) è una lesione polmonare infiammatoria acuta caratterizzata da insufficienza respiratoria a rapida progressione, edema polmonare, danno alveolare diffuso e infiltrazione di cellule infiammatorie.1 La sepsi è un fattore di rischio comune per l'ARDS e la prognosi del paziente è peggiorata in presenza di sepsi .2 Studi precedenti hanno suggerito che più biomarcatori plasmatici, come l'interleuchina-6 (IL-6), l'interleuchina-8 (IL-8), l'angiopoietina-2 (ANG-2), l'antigene Curbs von Lungren 6 (KL-6), recettore per i prodotti finali della glicazione avanzata (RAGE) e la proteina tensioattiva D (SP-D), avevano un valore predittivo per la prognosi dell'ARDS.3-5 Prove crescenti hanno mostrato che diverse funzioni biologiche sono coinvolte anche nella patogenesi dell'ARDS indotto dalla sepsi, comprese le cellule proliferazione, apoptosi e autofagia.6–8 Tra queste funzioni biologiche, l'autofagia gioca un ruolo essenziale nello sviluppo dell'ARDS indotto dalla sepsi.L'autofagia ("auto-mangiante") è il processo attraverso il quale parti della cellula vengono degradate nel lisosoma.9 Negli ultimi decenni, ci sono state alcune vie di segnalazione, che sono state segnalate per influenzare le funzioni biologiche dell'ARDS attraverso l'autofagia.Ad esempio, uno studio precedente ha dimostrato che l'autofagia attenua l'infiammazione polmonare, la permeabilità polmonare e l'ipossiemia sottoregolando il dominio pirinico della famiglia NLR contenente 3 (NLRP3) e l'attività delle vescicole infiammatorie dell'interleuchina-1β (IL-1β) nel lipopolisaccaride (LPS) e nella ventilazione meccanica (MV modelli murini di danno polmonare acuto (ALI) indotto da ).10,11 Inoltre, l'attivazione dell'autofagia ha partecipato al processo fisiopatologico della sepsi e ha alleviato il rilascio eccessivo di citochine e il danno polmonare nella sepsi.6 Tuttavia, gli ARG dell'ARDS indotto dalla sepsi rimangono in gran parte sconosciuto e deve essere ulteriormente esplorato, il che ci fornirebbe potenziali biomarcatori per il trattamento dell'ARDS.In questo studio, abbiamo scaricato i dati GSE32707 dal database Gene Expression Omnibus (GEO).Successivamente, abbiamo identificato i DEARG chiave rilevanti per la diagnosi, che possono discriminare i pazienti con ARDS indotta da sepsi dai controlli.Successivamente, abbiamo utilizzato CIBERSORT per la prima volta per analizzare le differenze nell'infiltrazione immunitaria tra pazienti con ARDS indotta da sepsi e controlli in campioni di sangue intero.Infine, i livelli di espressione dei DEARG sono stati ulteriormente verificati nei pazienti con ARDS indotta da sepsi e negli individui sani.Un totale di 222 geni sono stati ottenuti da The Human Autophagy Database (//www.autophagy.lu/index.html).Abbiamo estratto le informazioni dai set di dati scaricati da Gene Expression Omnibus (GEO, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/).I profili di espressione genica GSE32707,12 ottenuti utilizzando la piattaforma GPL10558, contenevano 144 campioni di sangue umano, di cui 58 da pazienti con sepsi, 31 da pazienti con ARDS indotta da sepsi, 21 da pazienti con sindrome da risposta infiammatoria sistemica e 34 controlli sani.Tutti i pazienti sono stati sottoposti a ventilazione meccanica.I 21 campioni di sindrome da risposta infiammatoria sistemica e 58 campioni di sepsi sono stati esclusi dalla nostra analisi.La funzione normalize Between Arrays nel pacchetto limma è stata applicata per normalizzare tutti i profili di espressione genica.13 Tutte le analisi sono state eseguite utilizzando la versione del software R 3.5.3.(https://www.r-project.org/).Il flusso di lavoro del presente studio è mostrato nella Figura 1.Figura 1 Diagramma del flusso di lavoro dello studio.Figura 1 Diagramma del flusso di lavoro dello studio.La matrice di espressione normalizzata dei dati del microarray è stata scaricata dal set di dati GSE32707.Quindi è stato utilizzato il pacchetto "limma" del software R per identificare i DEARG.I geni con un valore P aggiustato <0,05 e un valore di variazione assoluta della piega >1,5 sono stati considerati geni espressi in modo differenziale.Il plot del vulcano, la heatmap e il box plot sono stati condotti utilizzando i pacchetti "ggplot2" e "heatmap" del software R.L'analisi dell'arricchimento del percorso GO e KEGG è stata condotta nel software R utilizzando il pacchetto "clusterProfiler".L'analisi GO consisteva in componente cellulare (CC), processo biologico (BP) e funzione molecolare (MF).L'analisi di correlazione dei DEARG è stata identificata utilizzando la correlazione di Spearman nel pacchetto "corplot" del software R.L'analisi PPI dei DEARG è stata analizzata utilizzando il database STRING (https://string-db.org/) e il software Cytoscape (versione 3.5.1).Le curve caratteristiche operative del ricevitore (ROC) sono state eseguite per calcolare l'area sotto la curva (AUC) su DEARG schermati il ​​cui valore diagnostico è stato valutato utilizzando l'analisi della curva ROC con il pacchetto software p ROC in R.14L'algoritmo CIBERSORT è stato utilizzato per trasformare il valore di espressione genica normalizzato nel componente delle cellule immunitarie del sangue periferico con la matrice della firma di riferimento LM22 impostata su 1000 permutazioni.15 Abbiamo mantenuto l'output CIBERSORT e calcolato la percentuale di sottotipi di cellule immunitarie in tutti i campioni.Abbiamo applicato CIBERSORT per caratterizzare le cellule immunitarie in ARDS indotta da sepsi e campioni di controllo.In R abbiamo utilizzato box plot per rappresentare i livelli di infiltrazione delle cellule immunitarie di diverse sottopopolazioni tra i due gruppi.Un totale di 6 pazienti con ARDS indotta da sepsi (casi) e 6 individui sani (controlli) di pari età e sesso sono stati ottenuti dal Primo Ospedale Affiliato dell'Università di Zhengzhou tra ottobre 2021 e novembre 2021. L'ARDS indotto da sepsi è stato definito secondo il Definizione del consenso di Berlino.16 La sepsi è stata definita secondo criteri standard.17 I 6 soggetti sani sono stati reclutati dal centro di controllo sanitario dell'ospedale.Questo studio è stato condotto in conformità con la Dichiarazione di Helsinki e approvato dal Comitato di etica medica dell'ospedale.Il consenso informato scritto è stato ottenuto da tutti i partecipanti.Il sangue venoso è stato raccolto da tutti i casi e controlli che hanno partecipato allo studio.I campioni di sangue di ciascun partecipante sono stati elaborati per isolare le cellule mononucleate del sangue periferico (PBMC) utilizzando la soluzione Ficoll (Solarbio Life Sciences, Pechino, Cina).L'RNA totale è stato estratto da PBMC con RNA Extraction Kit (TRIzon Reagent, Shanghai, Cina).La trascrizione inversa è stata condotta utilizzando Prime Script RT Master Mix Kit (Takara, Dalian, Cina).Il livello di mRNA è stato valutato utilizzando TB Green Premix Ex Taq Kit (Takara, Dalian, Cina) seguendo le istruzioni.I livelli di espressione relativa sono stati normalizzati a GAPDH.I primer sono disponibili nella tabella supplementare S1.L'espressione relativa dell'mRNA è stata calcolata con il metodo 2-ΔΔCt con la normalizzazione a GAPDH.Abbiamo analizzato l'espressione di 222 ARG in 31 pazienti con ARDS indotta da sepsi e 34 individui sani, e 28 ARG sono stati identificati utilizzando i criteri di valore P aggiustato <0,05 e valore di variazione assoluta della piega >1,5, inclusi 11 geni sovraregolati e 17 geni down-regolati (Tabella 1).A seguito dell'analisi del set di dati GSE32707 con il software R, i 28 DEARG tra ARDS indotto da sepsi e gruppi normali sono stati presentati nella trama del vulcano e nella mappa di calore (Figura 2A e B).Inoltre, i box plot hanno mostrato i modelli di espressione di 28 DEARG tra ARDS e campioni normali (Figura 3A e B).Tabella 1 I 28 DEAG nei campioni ARDS rispetto al campione sanoFigura 2 DEARG in ARDS indotta da sepsi e campioni sani.(A) Trama del vulcano dei 222 DEARG.I punti rossi rappresentano i geni significativamente sovraregolati e i punti blu indicano i geni significativamente sottoregolati.(B) Heatmap dei 28 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.Figura 3 Il boxplot di 28 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.(A) Il boxplot dei primi 14 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.(B) Il boxplot degli ultimi 14 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.I valori P sono stati calcolati utilizzando un test t di Student non accoppiato a due lati.*P<0,05;**P<0,01.Tabella 1 I 28 DEAG nei campioni ARDS rispetto al campione sanoFigura 2 DEARG in ARDS indotta da sepsi e campioni sani.(A) Trama del vulcano dei 222 DEARG.I punti rossi rappresentano i geni significativamente sovraregolati e i punti blu indicano i geni significativamente sottoregolati.(B) Heatmap dei 28 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.Figura 3 Il boxplot di 28 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.(A) Il boxplot dei primi 14 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.(B) Il boxplot degli ultimi 14 DEARG in ARDS indotto da sepsi e campioni sani.I valori P sono stati calcolati utilizzando un test t di Student non accoppiato a due lati.*P<0,05;**P<0,01.Abbiamo eseguito analisi di arricchimento GO e KEGG utilizzando il software R per determinare la potenziale funzione dei DEARG nello sviluppo dell'ARDS indotto dalla sepsi.L'analisi BP ha mostrato che questi geni sono associati all'autofagia, al processo che utilizza l'autofagia, nonché alla macroautofagia nell'ARDS indotto dalla sepsi (Figura 4A).In termini di CC, questi geni erano coinvolti nell'autofagosoma, nella membrana vacuolare e nel granulo ricco di ficolin-1 (Figura 4A).Per quanto riguarda MF, questi geni hanno partecipato ad alcune funzioni chiave, come il legame della molecola di adesione cellulare, il legame della caderina e il legame della proteasi (Figura 4A) (Tabella Supplementare S2).Inoltre, l'analisi dell'arricchimento del percorso KEGG ha indicato che questi geni erano associati all'autofagia-animale, all'apoptosi, al percorso di segnalazione PI3K-Akt.(Figura 4B, tabella supplementare S3).Figura 4 Arricchimento funzionale dei DEARG.(A) BP, processo biologico;CC, componente cellulare;MF, funzione molecolare.(B) Analisi dell'arricchimento del percorso KEGG.Figura 4 Arricchimento funzionale dei DEARG.(A) BP, processo biologico;CC, componente cellulare;MF, funzione molecolare.(B) Analisi dell'arricchimento del percorso KEGG.Per esplorare la correlazione di espressione di questi ARG, è stata eseguita l'analisi di correlazione.I risultati hanno rivelato la relazione dei 28 DEARG nel set di dati GSE32707 (Figura 5).Per determinare le interazioni tra i DEARG, è stata eseguita l'analisi PPI.I risultati hanno dimostrato che questi ARG interagivano tra loro (Figura 6).Figura 5 Analisi di correlazione di Spearman dei 28 DEARG.Figura 6 Analisi delle interazioni proteina-proteina (PPI) i 28 DEARG.I cerchi rossi e blu indicano rispettivamente geni espressi differenzialmente sovraregolati e sottoregolati.La dimensione del cerchio indica il grado del nodo.Figura 5 Analisi di correlazione di Spearman dei 28 DEARG.Figura 6 Analisi delle interazioni proteina-proteina (PPI) i 28 DEARG.I cerchi rossi e blu indicano rispettivamente geni espressi differenzialmente sovraregolati e sottoregolati.La dimensione del cerchio indica il grado del nodo.Abbiamo eseguito l'analisi della curva ROC utilizzando R Studio per convalidare ulteriormente l'affidabilità di questi ARG nel sangue periferico dei pazienti.Sette geni (BAG3, CTSD, ERBB2, MYC, PEA15, RAB24 e SIRT1) con un'AUC maggiore di 0,70 sono stati considerati geni hub, indicando che potrebbero essere in grado di diagnosticare pazienti con ARDS correlata alla sepsi con eccellente specificità e sensibilità (figura 7).Figura 7 Curve ROC per valutare il valore diagnostico dei DEARG.Abbreviazione: IC 95%, intervallo di confidenza.Figura 7 Curve ROC per valutare il valore diagnostico dei DEARG.La distribuzione complessiva di diversi sottoinsiemi immunitari in tutti i campioni è stata mostrata in un istogramma (Figura 8A).Diversi colori e altezze rappresentano vari tipi e percentuali di cellule immunitarie nel campione e la somma della proporzione di varie cellule immunitarie è 1. Cellule T CD8+, cellule T CD4+ naive, cellule T CD4+ a riposo in memoria, cellule T helper follicolari, gamma cellule delta T, monociti, mastociti a riposo, eosinofili e neutrofili erano le cellule infiltranti primarie.Ci sono differenze individuali nella proporzione di cellule immunitarie tra i due gruppi.I diversi sottoinsiemi di cellule immunitarie erano da debolmente a moderatamente correlati (Figura 8B).Rispetto ai controlli sani, la proporzione di cellule T CD4+ naive, cellule T gamma delta, monociti e neutrofili era maggiore nei campioni ARDS correlati alla sepsi, mentre la frazione di cellule T CD8+, cellule T CD4+ a riposo in memoria, cellule T helper follicolari, mastociti a riposo e gli eosinofili erano relativamente inferiori (Figura 8C).Figura 8 I profili del modello di distribuzione del sottotipo di cellule immunitarie nella coorte GSE32707.(A) Il grafico a barre che visualizza la percentuale relativa di 22 cellule immunitarie in ciascun campione.(B) Mappa termica di correlazione di tutte le 22 cellule immunitarie.(C) Boxplot di tutte le 22 frazioni immunitarie infiltrate in modo differenziato.I valori P sono stati calcolati utilizzando un test t di Student non accoppiato a due lati.*P<0,05;**P<0,01.Abbreviazione: ns, non significativo.Figura 8 I profili del modello di distribuzione del sottotipo di cellule immunitarie nella coorte GSE32707.(A) Il grafico a barre che visualizza la percentuale relativa di 22 cellule immunitarie in ciascun campione.(B) Mappa termica di correlazione di tutte le 22 cellule immunitarie.(C) Boxplot di tutte le 22 frazioni immunitarie infiltrate in modo differenziato.I valori P sono stati calcolati utilizzando un test t di Student non accoppiato a due lati.*P<0,05;**P<0,01.Per convalidare l'affidabilità dei sette livelli di espressione DEARG che sono stati ulteriormente identificati da qRT-PCR nei nostri campioni clinici.I risultati di qRT-PCR hanno indicato che il CTSD era sovraregolato e altri quattro geni (BAG3, ERBB2, MYC e SIRT1) erano sottoregolati.Solo l'espressione di PEA15 ed ERBB2 non era coerente con la nostra analisi integrata (Figura 9).Figura 9 L'espressione di RNA di sette DEARG è stata misurata in ARDS indotta da sepsi e campioni sani.(A) L'espressione dell'RNA di BAG3, CTSD, ERBB2, MYC, PEA15, RAB24 e SIRT1 è stata misurata in campioni di sangue utilizzando qRT-PCR.I valori P sono stati calcolati utilizzando un test t di Student non accoppiato a due lati.**P<0,01.Abbreviazione: ns, non significativo.Figura 9 L'espressione di RNA di sette DEARG è stata misurata in ARDS indotta da sepsi e campioni sani.(A) L'espressione dell'RNA di BAG3, CTSD, ERBB2, MYC, PEA15, RAB24 e SIRT1 è stata misurata in campioni di sangue utilizzando qRT-PCR.I valori P sono stati calcolati utilizzando un test t di Student non accoppiato a due lati.**P<0,01.L'ARDS indotta da sepsi ha un recupero più scarso dal danno polmonare, una gravità generale della malattia più elevata e una mortalità più elevata rispetto all'ARDS non indotto da sepsi.18 Sfortunatamente, i meccanismi dell'ARDS indotto da sepsi rimangono ancora poco chiari e mancano terapie efficaci.Prove crescenti suggeriscono che l'autofagia gioca un ruolo critico nella patogenesi dell'ARDS indotta da sepsi.L'autofagia è un'arma a doppio taglio.Nelle fasi iniziali, l'ARDS indotto dalla sepsi può attivare varie proteine ​​​​correlate all'autofagia, che riducono il rilascio di citochine, la risposta infiammatoria e l'apoptosi nel polmone.6,19,20 Un'altra evidenza suggerisce che l'autofagia, in virtù dell'eccessivo accumulo di autofagosomi, può svolgono un ruolo disadattivo nelle fasi avanzate dell'ARDS correlata alla sepsi.21,22 Pertanto, è urgente migliorare la comprensione dell'autofagia nella patogenesi dell'ARDS indotta dalla sepsi mediante ampie convalide.Recentemente, una serie di studi ha esplorato che l'autofagia è associata all'ARDS indotto dalla sepsi.I risultati di Colell et al hanno indicato che la gliceraldeide-3-fosfato deidrogenasi (GAPDH) proteggeva dal danno polmonare correlato alla sepsi promuovendo l'autofagia mediata dall'autofagia 12 (ATG12) e migliorando lo stress ossidativo.23,24 Inoltre, uno studio recente ha scoperto che MicroRNA -377-3p rilasciato dagli esosomi delle cellule staminali mesenchimali migliora l'ALI indotta da LPS prendendo di mira RPTOR per indurre l'autofagia.25 Un altro studio ha riportato che le cellule T regolatorie CD39+ attenuano l'ALI indotta da LPS tramite l'autofagia e la via ERK/FOS.26 Tuttavia, l'analisi bioinformatica di Gli ARG non sono stati ben esplorati nell'ARDS indotta da sepsi.In questo studio, abbiamo identificato 28 potenziali DEARG di ARDS indotto dalla sepsi mediante analisi bioinformatica.Le potenziali funzioni biologiche di questi DEARG sono state eseguite dall'analisi di arricchimento GO e KEGG che ha indicato principalmente un ruolo chiave dell'autofagia nei meccanismi fisiopatologici dell'ARDS indotto dalla sepsi.Abbiamo inoltre eseguito le curve ROC per valutare la capacità diagnostica dei DEARG nell'ARDS indotta da sepsi.I sette geni (BAG3, CTSD, ERBB2, MYC, PEA15, RAB24 e SIRT1) sono stati indicati che potrebbero essere in grado di diagnosticare pazienti con ARDS indotta da sepsi con specificità e sensibilità eccellenti.Numerose ricerche hanno confermato che il sistema immunitario gioca un ruolo centrale nell'ARDS indotta dalla sepsi.Pertanto, abbiamo utilizzato CIBERSORT, un algoritmo di deconvoluzione del trascrittoma, per calcolare la proporzione di sottoinsiemi di cellule immunitarie del sangue in grado di comprendere meglio il ruolo dell'infiltrazione dei leucociti e della risposta infiammatoria nella patogenesi e nello sviluppo dell'ARDS correlata alla sepsi.Inoltre, c'erano ovviamente differenze anche nella proporzione della maggior parte delle 22 cellule immunitarie tra ARDS correlata alla sepsi e controlli sani.Queste differenze includono un aumento della proporzione di cellule T CD4+ naive, cellule T gamma delta, monociti e neutrofili, mentre la frazione di cellule T CD8+, cellule T CD4+ a riposo in memoria, cellule T helper follicolari, mastociti a riposo ed eosinofili era relativamente inferiore nell'ARDS indotta da sepsi.Infine, sulla base dei risultati dell'analisi bioinformatica, i livelli di espressione di sette DEARG sono stati ulteriormente identificati mediante qRT-PCR nei nostri campioni clinici.CTSD è stato sovraregolato e gli altri quattro geni (BAG3, ERBB2, MYC e SIRT1) sono stati sottoregolati.Solo l'espressione di PEA15 ed ERBB2 non era coerente con la nostra analisi integrata.Alcuni di questi geni verificati sono stati segnalati per essere associati a ARDS correlata alla sepsi.Liu et al hanno rivelato che SIRT1 può migliorare l'autofagia cellulare regolando l'ATG7 e alleviare l'ARDS indotto da LPS.27 Dong et al hanno scoperto che le espressioni di LC3 e ATG16 sono elevate nell'autofagia attivata, che mantiene l'integrità funzionale della barriera e degli aderenti nel modello murino di ALI .Inoltre, l'autofagia attivata può alleviare il rilascio di citochine e migliorare ulteriormente l'ALI evocata dalla stimolazione LPS nei topi.28 Tuttavia, il meccanismo esplicito per cui questi geni verificati rimangono in gran parte poco chiaro nell'ARDS indotto dalla sepsi necessita di ulteriore esplorazione.La nostra ricerca presenta inevitabilmente dei limiti.In primo luogo, la nostra ricerca rappresenta la seconda estrazione e analisi di set di dati precedentemente pubblicati, quindi non conoscevamo la gravità dei pazienti, i metodi di trattamento e i dati clinici rilevanti, che potrebbero aver confuso i fattori nella nostra analisi.In secondo luogo, il piccolo numero di campioni clinici è stato utilizzato per l'analisi, che saranno necessari ulteriori studi con una più ampia coorte di ARDS indotta da sepsi per confermare ed estendere ulteriormente le conclusioni di questo studio.In terzo luogo, abbiamo verificato solo il livello di espressione dei geni correlati all'autofagia differenzialmente espressi nei campioni clinici, a causa della mancanza di informazioni dettagliate sull'ARDS indotto dalla sepsi, è difficile tracciare una chiara associazione tra i geni selezionati e la gravità della sepsi indotta ARDS utilizzando gli stessi campioni.Pertanto, i meccanismi dell'ARDS indotto dalla sepsi sono necessari per esplorare ulteriormente gli esperimenti in vitro o in vivo.Abbiamo identificato un'associazione tra DEG e infiltrazione immunitaria nell'ARDS indotta da sepsi e convalidato BAG3, CTSD, ERBB2, MYC e SIRT1 che potrebbero avere eccellenti prestazioni diagnostiche.I dati GSE32707 sono stati scaricati dal database Gene Expression Omnibus (GEO) (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/).I 222 geni sono stati ottenuti da The Human Autophagy Database (//www.autophagy.lu/index.html).Tutte le procedure eseguite negli studi che coinvolgono esseri umani sono state riviste e consentite dal Primo ospedale affiliato dell'Università di Zhengzhou (2020-KY-462, 24 novembre 2020).Il consenso informato scritto è stato ottenuto da tutti i singoli partecipanti inclusi nello studio.Lo studio è stato condotto in conformità con la Dichiarazione di Helsinki.Questo studio è stato sostenuto dalla National Natural Science Foundation of China (82074212).Tutti gli autori hanno dato un contributo significativo al lavoro riportato, sia nella concezione, nella progettazione dello studio, nell'esecuzione, nell'acquisizione dei dati, nell'analisi e nell'interpretazione, sia in tutte queste aree;ha partecipato alla stesura, revisione o revisione critica dell'articolo;ha dato l'approvazione definitiva alla versione da pubblicare;hanno concordato la rivista a cui è stato presentato l'articolo;e accetta di essere responsabile di tutti gli aspetti del lavoro.Gli autori non segnalano conflitti di interesse in questo lavoro.1. Thompson BT, Chambers RC, Liu KD, Drazen JM.Sindrome da distress respiratorio acuto.N inglese J Med.2017;377(6):562–572.doi:10.1056/NEJMra16080772. Xue M, Sun Z, Shao M, et al.Utilità diagnostica e prognostica del fattore tissutale per sepsi grave e danno polmonare acuto indotto da sepsi.J Transl Med.2015;13:172.3. Calfee CS, Gallagher D, Abbott J, et al.Angiopoietina-2 plasmatica nel danno polmonare acuto clinico: significato prognostico e patogenetico.Crit Care Med.2012;40(6):1731–1737.4. Zhao Z, Wickersham N, Kangelaris KN, et al.Validazione esterna di un biomarcatore e modello di previsione clinica per la mortalità ospedaliera nella sindrome da distress respiratorio acuto.Terapia Intensiva Med.2017;43(8):1123–1131.5. Sato H, Callister ME, Mumby S, et al.I livelli di KL-6 sono elevati nel plasma di pazienti con sindrome da distress respiratorio acuto.Eur Respir J. 2004;23(1):142–145.6. 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